涂蜡：对于涂蜡古人也有不同的看法。认为砚之涂蜡是：“蜡中视石如隔云见日，昏翳闷人。且蜡石不发墨。”）此语是极有道理的。现在有不少制砚人将蜡涂遍砚身，有的还涂抹植物油，更有的涂沫墨，以为可以养砚，给人一种滋润古朴的感觉。但这些做法并不妥切，涂蜡封石是可以的，但方法须得当。蜡可以涂于砚了四周，底部要薄而适中；切忌将蜡涂于砚堂磨墨的部分，因为此处涂蜡，则水墨不融，亦不能发墨了。砚上抹植物油的作法也是不妥的，因为植物油属慢干性油脂，砚面有油多招尘土，使砚污秽不堪，并且日久油腻也会散发出一种
怪味来令人生厌，或者植物油产生霉变，在砚的表面出现一块块的霉斑，擦洗不去大煞风景。取砚：遇到砚壅塞砚匣之内，应双手将砚匣倒置于有毡的桌面上，轻敲匣边，使砚身重堕出匣为宜，切不可用金属物撬弄，以免损伤砚。
放砚：砚放在匣内，要依砚与匣的原来位置自然放入。特别是长方形的砚，上下边并非等长，多是底边略宽于上边，放砚时应视其宽窄放置。若不知其妙将砚倒置，紧塞砚匣，则会发生砚匣崩裂现象。
砚匣的收藏与保养：砚匣多为木质，清代初期佳砚的砚的匣也大多为优良木材制作，如红木，紫檀，黄花梨等。其砚匣之内壁还涂有漆数层，防止墨汁水份的蒸濡，使砚匣胀裂。另外砚匣还应经常打蜡，以保持光泽，防止潮气侵入。
若遇砚匣收缩，砚身放之不下时，此时可用砂纸打磨匣之内侧，使其增宽易放，切忌磨去砚，致遭“削足适履”之讥。
古砚匣因年代久远多有破烂和损坏，对于此类砚匣可采用匣外配匣的方法，以此对古砚匣进行收藏。因为古砚匣是研究砚匣的形制，工艺制作，髹漆技术等的珍贵实物，同时也是考证古砚年代，出处，流传轨迹等的佐证。
砚的配匣：
砚的配匣，并非一般的包装。砚放于文房书斋，久远流传。考究的砚匣颇受文人的重视。《砚林拾遗》中说到：“贮砚宜避光，漆木匣不宜纸，漆润纸燥也。”砚匣要具有美观赏价值和坚固的实用性，起到对砚的保护映衬作用。使匣“与砚同寿”，与砚的造型和谐统一，成为一个不可分割的整体。
砚匣的材质必须是硬度适宜，耐潮湿，能起到对砚的长期保护作用。砚匣材料的种类繁多，形式多样。其品种主要的可以分为木匣，漆匣，纸匣，锦匣，石匣，金属匣等几种。
以金属制匣的情况比较少，像东汉的铜兽形观盒，明和清初也偶有以铅锡合金制成的砚匣，其目的是保持砚匣内的水气达到养砚的目的，同时还可留住墨的香味。但总的来说金属较砚的硬度高，以金属为匣必然伤砚，且用砚研墨必用水，水则易使金属氧化生锈，剥落易损。宋代赵希鹄的《洞天清录》载：“砚匣不当用五金盖。石乃金之所出，金为石之精华。子母同处则子涂母气，反能燥石，而又诲盗。法法用佳漆为之。”
以石作匣的情况也不少，且多出现于近代石料较贱的砚种。石匣分为二种形式，一是匣和砚为一体，只是多了一只石的砚盖。此类砚匣石质外露，极易碰伤和受到气候干湿的影响，石质粗燥。二是匣和砚分为二种石质，砚套于石匣之中，但石匣终究吸水性较强，其细腻的程度与漆木不能相比，也不是制砚匣的良材。
木制砚匣的用材有紫檀，鸡丝，红木，花梨，金丝楠木，豆瓣楠木等等。其制作方法分整块木板剜出和皎镶二种。整料剜出的气派大，用料费，但木料易撬裂变形；拼镶的做工精巧细腻，但易脱胶散架。因此一般来说异形砚的砚匣以整料剜的为多，而四方，长方形的砚匣则普遍采用拼镶方法。异形砚的砚匣，依砚的外形相应制成砚匣，如瓜砚可制瓜形，蝉砚可制蝉形。但其匣形外的雕刻不可繁尽可能，杂则喧宾夺主，赘庸俗。砚匣的底部内侧应凿成与砚的外形相应的浅池状，不可成平板状，称为“起底”。起底不但使砚匣增添灵秀俊巧的艺术效果，而且其弧形拱状的力学结构可使砚匣坚实牢固。异形和几何形的砚匣都不可有棱角出现，拐角转折的地方要圆浑自然，手感舒适。再来谈谈砚匣的形制。砚匣虽然形式各异，材料多样，但其主要的形制不外底托式，底托加盖式和封闭式三种。
纸匣，锦匣只能起到色彩装潢的作用，往往做成匣外的套匣。
制作砚匣最理想的材料当为漆和木。以漆制成的砚匣，按照漆的工艺品种又可分为推光漆，雕漆，大漆，树脂漆等。有的在漆匣的盖上还采用描金，螺钿镶嵌，金银丝镶嵌，刻画书画等多种制作工艺。漆砚匣的制作首推清代初期扬州髹漆名手卢映之，卢葵生祖孙。当时是以优质的木材制成砚匣，其内壁也用推光漆髹，以防匣内水气涨裂砚匣。
底托式：此类形制多用于大型砚，砚下只有一只木雕的底托将砚制置于底托之上即可。
底托加盖式：俗称天地盖。此类形制多用于厚重的砚，如抄手砚等。匣由底托和上盖两部分组成，底托较上盖来得结实，使砚的四侧外露。其特点是启盖灵活，使用方便。
封闭式，即全盖式。不论是规则形砚或不规则的随形砚，多有用此形制的。其方法是：以砚定形，以形定匣。匣分上盖和下底两部分，底与盖的接触处均有子口，使之封闭严密。在砚匣高度的比例上，底高为砚匣总高的三分之一，盖则为砚匣总高的三分之二。这一高度比例的优点是：取砚开启方便，对砚的装潢起到烘托的作用。同样，砚匣的内部深度也要有适当的比例。如底托内深为砚高的三分之一较为适宜。这样利于砚的使用，观赏，洗涤。若砚陷进匣内过深，只露其表，不仅取砚脱匣不便，而且掩盖了砚的整体艺术效果。
豹脚，即有足之砚匣。使用这类砚匣务使其整体平稳，否则砚池注水以后会因砚匣的倾斜而溢出。豹脚的高度须适当，便于对砚的挪动为宜。同时砚匣的子口要吻合严密，不可高低不平，左右上下翘动。
